Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc171E9Q1U1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms