Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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