Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc62E9PVD1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms