Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cngb1E1AZ71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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