Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hfm1D3Z4R1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms