Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms