Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc8D3YZV8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms