Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm42791D3YYB5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms