Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms