Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms