Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rd3lB2RV38 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rd3lB2RV38 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rd3lB2RV38 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rd3lB2RV38 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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