Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apba1B2RUJ5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms