Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apol7aB2RT54 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms