Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spocd1B1ASB6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms