Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms