Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xlr4aA2BI40 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms