Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samt1A2BED8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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