Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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