Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms