Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms