Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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