Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxd11P23813 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxd11P23813 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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