Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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