Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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