Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn18P56857 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn18P56857 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn18P56857 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn18P56857 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn18P56857 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn18P56857 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn18P56857 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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