Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms