Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Top3bQ9Z321 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms