Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac5Q9Z2V6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac5Q9Z2V6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms