Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms