Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mecp2Q9Z2D6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mecp2Q9Z2D6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms