Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms