Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J1

Tcf7l1, Transcription factor 7-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7l1Q9Z1J1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf7l1Q9Z1J1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7l1Q9Z1J1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms