Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ror1Q9Z139 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms