Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms