Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp16Q9WTR0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp16Q9WTR0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms