Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms