Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slit2Q9R1B9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slit2Q9R1B9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms