Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrg1Q9R0Y8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms