Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt9Q9R0N9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt9Q9R0N9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms