Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms