Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms