Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn4Q9QXZ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms