Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms