Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUR8

Sema7a, Semaphorin-7A, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema7aQ9QUR8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema7aQ9QUR8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema7aQ9QUR8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema7aQ9QUR8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms