Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms