Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma6Q9QUM9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms