Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms