Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nova1Q9JKN6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nova1Q9JKN6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms