Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod2Q9JKK7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmod2Q9JKK7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms