Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl39Q9JKF7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl39Q9JKF7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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